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imagej2x是一款非常好用的圖像編輯處理軟件,它是專為醫(yī)學(xué)影像處理而設(shè)計(jì)的,軟件可以幫助用戶測(cè)量角度和距離,計(jì)算面積和像素值統(tǒng)計(jì)生成直方圖,并具備收集標(biāo)準(zhǔn)的圖像處理工具,包括銳化,平滑,對(duì)比度修改或圖形效果等。
imagej2x支持用戶自定義插件和宏。imagej2x自帶編輯器, 并且導(dǎo)入了java的編譯器,實(shí)現(xiàn)了簡單的IDE功能, 用戶可直接基于ImageJ進(jìn)行圖像處理。
imagej2x通過Java插件被設(shè)計(jì)為開放體系結(jié)構(gòu)的,可以獲取定制的分析、處理插件,這些插件都能夠使用imagej2x內(nèi)置的編輯器和編譯器。用戶自定義插件可以解決幾乎所有圖像處理和分析方面的問題。
imagej2x的源代碼免費(fèi)提供。
主面由菜單欄,工具欄和狀態(tài)欄組成。
菜單欄包括:文件,編輯,圖形,處理,分析,插件,窗口,幫助。
文件主要有:文件打開,關(guān)閉,保存等功能,比較特殊的一個(gè)功能是恢復(fù)功能??梢灾苯踊氐缴洗伪4孢^的狀態(tài)。
imagej2x這套軟件可以自動(dòng)幫你你計(jì)算細(xì)胞數(shù),也可以定量分析DNA電泳或是Western blot條帶,下面小編就來教教大家具體的操作方法。
1、首先打開軟件后,開啟圖檔,如下圖所示:
2、請(qǐng)先做校正,選擇Analyze底下的Calibrate選項(xiàng),再選擇校正的模式,使用Uncalibrate OD,再按ok 按下ok之后會(huì)出現(xiàn)校正的圖形,如下圖所示:
3、在要分析的第一條(first lane)加上一個(gè)長型框(工具列第一個(gè)選項(xiàng)),再按下Analyze/Gels/select first Lane快速鍵(Ctr+1),此時(shí)框架中會(huì)出現(xiàn)一個(gè)號(hào)碼1,之后可以移動(dòng)框架到第二個(gè)lane再選擇Analyze/Gels/select second Lane快速鍵(Ctr+2),當(dāng)然可以一直加下去,最后按Analyze/Gels/plot Lanes快速鍵(Ctr +3),如下圖所示:
4、分析以后會(huì)出現(xiàn)圖型表示你剛選擇的框內(nèi)的影像強(qiáng)度,此時(shí)可以看到有幾個(gè)比較高的區(qū)段,就是我們想定量的band,使用直線工具(工具列第五個(gè)選項(xiàng))先將圖形中高點(diǎn)為有band的區(qū)域和沒有band的區(qū)域分開再,使用魔術(shù)棒工具(工具列第八個(gè)選項(xiàng))點(diǎn)選要分析的區(qū)域,如下圖所示:
5、當(dāng)我們點(diǎn)選分析時(shí),在result的對(duì)話視窗會(huì)出現(xiàn)分析的數(shù)據(jù),依序點(diǎn)選就會(huì)出現(xiàn)每個(gè)band的值,如下圖所示:
注意:當(dāng)我們選擇分析的條帶也可以是橫向選取,就可以只比較相同大小的DNA的含量,同樣也可以應(yīng)用在western blot或其它類似實(shí)驗(yàn)條帶的分析上。
標(biāo)簽: imagej2x 醫(yī)學(xué)軟件 影像處理
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