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Discovery Studio 是一款面向生命科學領(lǐng)域的新一代分子建模和模擬環(huán)境。軟件整合了廣泛的資訊學、分子模型建造和模擬工具,應用于蛋白質(zhì)體、標靶藥物開發(fā)過程與研究,為科學家提供易用的蛋白質(zhì)序列比對、優(yōu)化、結(jié)構(gòu)藥物設(shè)計工具。
生物大分子:蛋白/核酸的序列分析、蛋白進化分析、蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的預測與模擬、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)表面電荷分析及pKa值預測、膜蛋白的結(jié)構(gòu)預測與模擬、抗體結(jié)構(gòu)的預測與模擬、蛋白理性設(shè)計、虛擬氨基酸突變、二硫鍵預測、虛擬丙氨酸掃描、虛擬飽和突變、蛋白聚集效應預測、抗體的設(shè)計與優(yōu)化、抗體人源化、抗體親和力成熟、酶的設(shè)計與優(yōu)化、核酸的設(shè)計與模擬、蛋白-蛋白(核酸/多肽)相互作用預測、蛋白-小分子相互作用預測、X-ray晶體結(jié)構(gòu)解析等;
計算化學:分子力學計算和分子動力學模擬、拉伸分子動力學模擬、量子力學/分子力學(QM/MM)計算等;
基于靶標結(jié)構(gòu)藥物設(shè)計:基于靶標結(jié)構(gòu)的化合物虛擬篩選、全新藥物設(shè)計、me too/me better藥物設(shè)計、藥靶作用機制解釋、分子對接、基于片段的藥物設(shè)計與改造等;
基于配體藥物設(shè)計部分:完全基于配體的藥效團設(shè)計、基于配體-受體復合物的藥效團設(shè)計、化合物數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建和篩選、藥效團數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建與保存、基于藥效團數(shù)據(jù)庫的反向找靶、定量構(gòu)效關(guān)系分析(QSAR/QSPR)、構(gòu)效關(guān)系分析(MMP)、虛擬組合化學庫的設(shè)計與分析、類藥性篩選、化合物構(gòu)象搜索和分析、化合物ADMET性質(zhì)預測等。
使用CHARMm c41b1進行分子力學(MM)計算
支持廣泛的電源領(lǐng)域,包括CGenFF,charmm36,charmm27,charmm22,CHARMm,CHARMm-polarH,CFF,MMFF等。
完全支持CHARMM分區(qū)機制并支持自定義無效定義
使用天生的CHARMm溶劑模型(GB)快速準確地電離蛋白質(zhì)和殘余pKs。
飲用水的快速溶劑,具有適用于非常大分子系統(tǒng)的可選抗離子
根據(jù)國標執(zhí)行任何溶劑明確或最小化溶劑基分子力學(MM)
基于溶劑進行明確的溶劑或分子動力學模擬
為蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)添加隱含膜,以便您可以基于場強制定模擬模型。
使用基于CHARMm的對接引擎CDOCKER來執(zhí)行基于配體的配體結(jié)合和精煉對接。
1、下載并安裝原程序,復制msi.lic許可證文件到如下路徑中
C:\Program Files (x86)\Accelrys\LicensePack\Licenses\
C:\Program Files (x86)\Accelrys\LicensePack\share\data\
C:\Program Files (x86)\Accelrys\LicensePack\win32\bin\
4、破解完成,打開Web控制端,可以根據(jù)需要安裝應用,可安裝的應用包括
BIOVIA Draw
Data Source Builder
Discovery Studio
BIOVIA Plugin
比如安裝Discovery Studio,直接點擊Install Discovery Studio,即可下載安裝程序
6、如果需要登陸管理員,輸入賬號密碼登陸即可
賬號和密碼見于壓縮包內(nèi)的Readme.txt
標簽: Discovery Studio 分子模型
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